Details for gene set KEGG

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_PVAL
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	KEGG_LYSOSOME
Enrichment Score (ES)	0.14909478
Normalized Enrichment Score (NES)	1.9399612
Nominal p-value	0.0058708414
FDR q-value	0.08322333
FWER p-Value	0.494

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	CTSO	83	0.998	0.0039	Yes
2	LAMP1	193	0.992	0.0064	Yes
3	PPT2	210	0.990	0.0140	Yes
4	CTSA	260	0.988	0.0197	Yes
5	LAMP2	338	0.981	0.0240	Yes
6	ARSG	416	0.977	0.0282	Yes
7	GBA	593	0.967	0.0271	Yes
8	NAGA	749	0.959	0.0271	Yes
9	CLN3	911	0.952	0.0269	Yes
10	HYAL1	1012	0.947	0.0299	Yes
11	CTSS	1081	0.943	0.0346	Yes
12	PSAP	1267	0.932	0.0330	Yes
13	LIPA	1277	0.931	0.0409	Yes
14	PPT1	1949	0.895	0.0131	Yes
15	NAPSA	2041	0.890	0.0166	Yes
16	CLN5	2247	0.880	0.0139	Yes
17	LAPTM5	2357	0.874	0.0164	Yes
18	AP1M1	2390	0.873	0.0231	Yes
19	HGSNAT	2439	0.870	0.0289	Yes
20	CTSF	2556	0.864	0.0310	Yes
21	AP3S2	2683	0.857	0.0326	Yes
22	CLTC	2844	0.848	0.0324	Yes
23	CTSG	2911	0.844	0.0372	Yes
24	NEU1	2932	0.843	0.0445	Yes
25	ATP6V0A4	3261	0.823	0.0352	Yes
26	GAA	3487	0.813	0.0315	Yes
27	AP3B1	3658	0.803	0.0307	Yes
28	MAN2B1	3667	0.803	0.0387	Yes
29	M6PR	3754	0.798	0.0424	Yes
30	CLTCL1	3770	0.797	0.0500	Yes
31	MCOLN1	3892	0.790	0.0519	Yes
32	LAPTM4A	3996	0.785	0.0547	Yes
33	CTSZ	4159	0.775	0.0544	Yes
34	ATP6V0C	4268	0.769	0.0569	Yes
35	ATP6V0D2	4359	0.765	0.0605	Yes
36	GNPTG	4361	0.765	0.0688	Yes
37	CTSK	4577	0.753	0.0656	Yes
38	AP1G1	4582	0.753	0.0738	Yes
39	GLB1	4680	0.747	0.0770	Yes
40	NAGLU	4895	0.736	0.0738	Yes
41	AP3S1	4949	0.732	0.0794	Yes
42	SLC17A5	5097	0.723	0.0798	Yes
43	GNS	5514	0.700	0.0658	Yes
44	CTSE	5812	0.685	0.0581	Yes
45	AP3M1	5840	0.684	0.0651	Yes
46	ARSA	5935	0.679	0.0684	Yes
47	IDUA	5985	0.676	0.0741	Yes
48	AP4B1	6089	0.670	0.0770	Yes
49	ENTPD4	6447	0.651	0.0661	Yes
50	CD68	6493	0.650	0.0721	Yes
51	DNASE2	6623	0.642	0.0735	Yes
52	LAPTM4B	6713	0.636	0.0771	Yes
53	CLTA	6816	0.630	0.0800	Yes
54	HEXA	7113	0.614	0.0724	Yes
55	SLC11A1	7394	0.600	0.0657	Yes
56	SMPD1	7573	0.591	0.0645	Yes
57	ATP6V1H	7574	0.591	0.0729	Yes
58	CD164	7579	0.591	0.0811	Yes
59	AP3B2	7642	0.587	0.0861	Yes
60	CTSC	7717	0.583	0.0905	Yes
61	AGA	7820	0.579	0.0934	Yes
62	SLC11A2	8120	0.562	0.0857	Yes
63	CLTB	8161	0.559	0.0919	Yes
64	NPC1	8254	0.554	0.0953	Yes
65	AP4E1	8564	0.536	0.0871	Yes
66	CD63	8617	0.533	0.0927	Yes
67	CTSB	8813	0.523	0.0905	Yes
68	FUCA1	8837	0.521	0.0977	Yes
69	ACP5	8878	0.518	0.1039	Yes
70	SORT1	9043	0.508	0.1035	Yes
71	AP1B1	9056	0.507	0.1112	Yes
72	AP3D1	9192	0.501	0.1123	Yes
73	ATP6V0A1	9456	0.487	0.1065	Yes
74	SCARB2	9511	0.484	0.1120	Yes
75	ABCA2	9542	0.483	0.1188	Yes
76	AP1M2	9569	0.482	0.1258	Yes
77	SGSH	9620	0.478	0.1315	Yes
78	IDS	9654	0.476	0.1381	Yes
79	DNASE2B	9675	0.475	0.1454	Yes
80	IGF2R	9764	0.470	0.1491	Yes
81	TPP1	9927	0.460	0.1487	No
82	AP1S3	10177	0.446	0.1437	No
83	GALNS	10586	0.424	0.1301	No
84	ATP6AP1	10599	0.423	0.1378	No
85	NAGPA	11270	0.387	0.1100	No
86	GGA2	11283	0.386	0.1178	No
87	TCIRG1	11375	0.381	0.1213	No
88	GUSB	11428	0.378	0.1269	No
89	ASAH1	11640	0.367	0.1239	No
90	LGMN	11880	0.350	0.1194	No
91	ACP2	12173	0.334	0.1120	No
92	PLA2G15	12262	0.329	0.1156	No
93	ATP6V0A2	13359	0.267	0.0648	No
94	SUMF1	13691	0.249	0.0554	No
95	CTSD	13873	0.238	0.0540	No
96	AP1S2	14090	0.227	0.0507	No
97	CTSH	14140	0.224	0.0565	No
98	CTSW	14575	0.200	0.0414	No
99	AP4S1	14809	0.188	0.0373	No
100	GM2A	14930	0.182	0.0392	No
101	AP4M1	14964	0.180	0.0458	No
102	MANBA	14993	0.178	0.0527	No
103	PSAPL1	15307	0.161	0.0442	No
104	GGA1	15422	0.156	0.0464	No
105	HEXB	15527	0.150	0.0492	No
106	ATP6V0D1	15653	0.143	0.0509	No
107	LAMP3	15867	0.132	0.0478	No
108	GALC	16023	0.123	0.0478	No
109	AP3M2	16170	0.116	0.0483	No
110	AP1S1	16358	0.105	0.0466	No
111	NPC2	16415	0.102	0.0520	No
112	MFSD8	16996	0.072	0.0291	No
113	ATP6V0B	17043	0.069	0.0350	No
114	GNPTAB	17188	0.063	0.0356	No
115	GLA	17300	0.057	0.0380	No
116	GGA3	17507	0.046	0.0353	No
117	CTNS	17773	0.034	0.0294	No
118	ABCB9	18217	0.013	0.0139	No
119	ARSB	18473	0.004	0.0085	No